ঢাকার সন্তান মনির উদ্দীন পাপ্পু ১৯৯৩ সালে যুক্ত হন বাংলাদেশ ছাত্র ফেডারেশনের সাথে। স্কুল জীবন থেকেই যুক্ত ছিলেন সামাজিক ও সাংস্কৃতিক কর্মকা-ের সাথে। দায়িত্ব পালন করেছেন ঢাকা মহানগর ছাত্র ফেডারেশনের সভাপতি এবং ২০০৬ থেকে ২০০৮ সাল পর্যন্ত কেন্দ্রীয় সভাপতি হিসেবে।

২০০৩ সালে সামসুন্নাহার আন্দোলন এবং ২০০৪ সালে বুয়েটে সানি হত্যার প্রতিবাদে গড়ে ওঠা আন্দোলনে বাংলাদেশ ছাত্র ফেডারেশনের নেতৃত্বমূলক ভূমিকার কারণে তৎকালীণ সভাপতি ফিরোজ আহমেদ ও মনির উদ্দীন পাপ্পুসহ ৬ নেতা গ্রেফতার হন এবং প্রায় ২ মাস কারাবন্দী থেকে মুক্ত হন।

২০০২ সালে গণসংহতি আন্দোলন প্রতিষ্ঠার সময় ছাত্র নেতা হিসেবে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করেন।